Старт эксперимента по картированию ответа на цитозольную ДНК и цитотоксичности к Имиквимоду

В нашей лаборатории стартовал большой эксперимент, целью которого является генетическое картирование ответа на цитозольную ДНК, а также картирование цитотоксичности к Имиквимоду. Появление ДНК (ядерной или митохондриальной) в цитоплазме является сигналом опасности для клетки и вызывает иммунный ответ в виде увеличения экспрессии воспалительных белков. Имиквимод довольно давно применяется в клинике для лечения злокачественных образований поверхности кожи типа меланом. По этим причинам, изучение иммунного ответа на эти соединения довольно актуально. 

Моделью изучения иммунного ответа служили перитониальные макрофаги мышей. Ассоциация между фенотипом и генотипом проводилась на потомках второго поколения от скрещивания С57BL/6 и MSM. Инбредные линии так называемых «диких» мышей (mus musculus musculus , mus musculus castaneus) эволюционировали от классических инбредных мышей более миллиона лет назад. В силу этого мышиные линии дикого типа (например, MSM) и их лабораторные сородичи (С57BL/6) имеют различное фенотипическое проявление на те или иные стимулы: инфекцию, септический шок, чужеродную ДНК (например, вирусную). Такие различия в фенотипе могут быть использованы в классическом генетическом анализе, в ходе которого осуществляется поиск генов, обуславливающих эти различия.

 

МИЛЛИОН СПОСОБОВ УМЕРЕТЬ — РЕГУЛЯЦИЯ ВОСПАЛИТЕЛЬНОЙ КЛЕТОЧНОЙ СМЕРТИ

«Миллион способов умереть — регуляция воспалительной клеточной смерти» — с таким названием лекции выступил Александр Николаевич Полторак (Tufts University, Boston, USA; ПетрГУ) 19 апреля 2019 г. на заседании Санкт-Петербургского научного общества иммунологов

Адрес:
ул. Академика Павлова, 12,
Институт экспериментальной медицины (ст.м. «Петроградская», «Черная речка»), «лондонский» корпус, 2 этаж,
конференц-зал отдела иммунологии
https://iemspb.ru/

СМЕРТЕЛЬНЫЙ НОМЕР

Поговорим о смерти… «Тысяча способов умереть — регуляция клеточной смерти» — с таким названием прошел 3 декабря 2018 семинар от Александра Николаевича Полторака в ИБ КарНЦ РАН.

Собравшиеся получили возможность узнать о типах клеточной смерти, таких как апоптоз, некроптоз, пироптоз, об их отличии друг от друга, механизме запуска, а также задать интересующие их вопросы.

На семинаре было подробно рассказано о последнем открытии лаборатории Александра Николаевича, а именно о процессе, морфологически похожем на пироптоз, но активируемым не классическими каспазами 1 и 11, а каспазой 8. Такой тип клеточной смерти был описан для макрофагов, инфицированных Yersinia pseudotuberculosis, которая похожа на Yersinia pestis (чумную палочку).

Данные исследования, опубликованные в в журнале Proceedings of the National Academy of Sciences, показывают, что человеческие макрофаги не способны инициировать пироптоз в ответ на бактериальную инфекцию и блокировку киназы ТАК1 одним их эффекторов Yersinii YopJ. Поскольку зараженные Yersinia человеческие клетки не погибали, они служили резервуаром инфекции, что, в конечном счете, повышало вероятность смертельного исхода у инфицированных людей. Переносчиком же чумной палочки, вероятно, служили не насекомые, а зараженные клетки грызунов.
В ходе обсуждения экспериментальных данных и будущих планов, ученый задумался над вопросом: если рассматривать смерть как дискретное событие (то есть клетка мертва или жива), то как объяснить тот факт, что из всего множества клеток с одинаковым геномом, у которых одинаково инициируется клеточная смерть, часть действительно гибнет, а часть выживает? Ответ на этот вопрос сможет дать сравнение полногеномной экспрессии в индивидуальных клетках.

РЕКОМЕНДАЦИИ ПО НОМЕНКЛАТУРЕ КЛЕТОЧНОЙ СМЕРТИ

the Nomenclature Committee on Cell Death (NCCD) призван обеспечить единое понимание терминов клеточной смерти согласно их морфологическим, биохимическим и функциональным особенностям. 

В прилагаемой статье, опубликованной в журнале Cell Death & Differentiation, приведены правила номенклатуры, даны действующие определения клеточной смерти и ее вариаций, рассмотрены механизмы запуска и передачи сигналов во время того или иного типа клеточной смерти.

https://www.nature.com/articles/s41418-017-0012-4

Caspase-8 induces cleavage of gasdermin D to elicit pyroptosis during Yersinia infection

В сентябре на indicator.ru вышла заметка о статье «Constitutive interferon signaling maintains critical threshold of MLKL expression to license necroptosis», опубликованной в журнале Cell Reports

Callista Images/Science Photo Library/Getty Images

Ссылки на заметки:
https://indicator.ru/news/2018/11/29/pochemu-chuma-gu..
https://www.gazeta.ru/science/news/2018/11/29/n_12349..
https://ria.ru/science/20181129/1533766960.html

Подробнее со статьей можно ознакомиться здесь: http://www.pnas.org/content/115/46/E10888.long

https://indicator.ru/news/2018/11/29/pochemu-chuma-gu..https://www.gazeta.ru/science/news/2018/11/29/n_12349..https://ria.ru/science/20181129/1533766960.html